מחקר בגובה העיניים
מחקר בגובה העיניים
עובדות ומספרים


חקר חלבונים בעזרת ספקטרוסקופיית תהודה מגנטית אלקטרונית
בסיועה של ספקטרוסקופיית תהודה מגנטית אלקטרונית, טכניקה המאפשרת לאפיין מבנים של חלבונים במערכות מורכבות, הצלחנו לעקוב מקרוב אחר הפעילות והמבנה של שני חלבונים קושרי נחושת ב-E. coli
תהודה מגנטית אלקטרונית (תמ"א) היא שיטה ספקטרוסקופית – כלומר כרוכה במדידת ספקטרום של רמות אנרגיה או של תדירויות אלקטרומגנטיות – המתבססת על אינטראקציות בין אלקטרונים לשדות מגנטיים. טכניקה זו מאפשרת לאפיין מבנים של חלבונים במערכות מורכבות ללא תלות בגודל החלבון או בסביבתו. במסגרת מחקר זה השתמשנו בספקטרוסקופיית תמ"א לחקר שני חלבונים קושרי נחושת בתא החיידק E. coli: הראשון שבהם הוא חלבון CusB הנמצא בפריפלזמה (כלומר המדור החיצוני) של התא. חלבון זה מווסת את כמות יוני הנחושת בתא על מנת למנוע את מותו עקב רעילות נחושת. הצלחנו, בעזרת ספקטרוסקופיית תמ"א ושיטות ביופיזיקליות וכימיות נוספות, להבין את מנגנון הפעולה של אותו חלבון ולאפיין את מוקדי קישור יוני הנחושת לחלבון. בנוסף פיתחנו פפטיד (שרשרת קצרה של חומצות אמיניות) שמעכב את פעילות החלבון ויכול להוות בסיס לפיתוח אנטיביוטיקות חדשות. המדידות נעשו בתוך מבחנה ובתוך התא. החלבון השני שחקרנו הוא חלבון שגורם לשעתוק (תהליך יצירת RNA לפי תבנית DNA) כתלות בריכוז יוני הנחושת בתא. עקבנו אחרי מנגנון הפעילות שלו, ולראשונה הצלחנו לאפיין את השינויים המבניים שמתרחשים בחלבון בזמן תהליך השעתוק. אפיינו חמישה מבנים שונים של החלבון: חלבון ללא נחושת, חלבון שקושר נחושת, חלבון שקושר DNA ושני מבנים של חלבון פעיל הקושר גם נחושת וגם DNA.