על אף שמערכת העיכול שלנו מכילה טריליוני חיידקים, הם בדרך כלל אינם גורמים לנו לחלות וחלקם אף מיטיבים עימנו. אלא שמעת לעת חודרים אלינו חיידקים "אלימים" עקב צריכה של מזון או מים מזוהמים. חיידקים אלה עשויים לגורם מחלות שיכולות להיות קשות מאוד. מדוע חיידקים אלימים אלה גורמים לנו לחלות? מה מבדיל אותם משאר טריליוני החיידקים במערכת העיכול שלנו, שמלווים אותנו ללא קושי ביומיום ואף חיוניים לבריאותנו? באופן כללי, התשובה ידועה לחוקרים: חיידקים מחוללי מחלות נושאים בקרבם חומר גנטי נוסף שאינו נמצא בשאר החיידקים בגופנו. החומר הגנטי הזה כולל מאות גנים המקודדים חלבונים שמהווים את מערך האלימות של החיידק, כולל מנגנוני התקפה שגורמים נזק לרקמות האדם החולה ומנגנוני הגנה שמאפשרים לחיידק להתחמק מהמערכת החיסונית. הידע לגבי דרך הפעולה של המנגנונים האלה עדיין דל מאוד ויש צורך דחוף להרחיב ולהעמיק אותו כדי שנוכל לפתח אסטרטגיות חדשות למניעת מחלות אלו ולטיפול בהן. מסיבה זו מתמקד המחקר שלנו בפענוח מנגנוני האלימות האלה. בין היתר, גילינו מספר חלבונים רעלנים שהחיידק משלח לתא הפונדקאי שלו בגוף, ותיארנו כיצד הם פועלים לשבש את ערוצי התקשורת של מערכת החיסון. בנוסף, חשפנו מערכות בהן משתמש החיידק לבקרה, ויסות ותאום הביטוי של הגנים האחראים לייצור מנגנוני האלימות. גם שפכנו אור על הדרך שבה משתמש החיידק כדי להחדיר את הרעלנים לתוך התאים הפונדקאים. לבסוף פענחנו כיצד החיידק והתא הפונדקאי חשים זה את זה ומגיבים על ידי הפעלה והשתקה של מנגנוני ההתקפה וההגנה.